Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms