Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q499Y3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q499Y3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q499Y3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q499Y3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms