Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms