Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms