Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDO1Q16878 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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