Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPROQ16827 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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