Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME3Q16798 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms