Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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