Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms