Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFE2Q16621 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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