Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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