Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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