Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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