Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCBQ16143 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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