Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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