Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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