Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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