Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TAF1AQ15573 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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