Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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