Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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