Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms