Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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