Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERV3-1Q14264 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms