Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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UBE4AQ14139 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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UBE4AQ14139 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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UBE4AQ14139 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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UBE4AQ14139 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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UBE4AQ14139 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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