Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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CDK13Q14004 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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CDK13Q14004 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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CDK13Q14004 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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CDK13Q14004 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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