Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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