Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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