Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR4Q13639 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms