Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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