Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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