Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms