Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1orf61Q13536 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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