Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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