Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RESTQ13127 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RESTQ13127 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RESTQ13127 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RESTQ13127 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RESTQ13127 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RESTQ13127 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RESTQ13127 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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