Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms