Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms