Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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