Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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