Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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