Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFEMP1Q12805 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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