Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SMAGPQ0VAQ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SMAGPQ0VAQ4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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