Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LRP1Q07954 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms