Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN1BQ07699 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms