Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms