Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms