Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNG1Q06432 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms