Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC9Q06265 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms