Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EMX2Q04743 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms