Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB1Q02818 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB1Q02818 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms