Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM3Q01628 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms